Inaugurato nel 1792 con il dramma per musica “I Giuochi d'Agrigento” del celebre Giovanni Paisiello su libretto di Alessandro Pepoli e il balletto “Amore e Psiche” di Onorato Viganò, musicato da Giulio Viganò, il nuovo teatro assunse immediatamente una posizione di assoluta preminenza nella città lagunare, riservandosi il genere in musica al tempo più prestigioso, l'opera seria.
Ricostruito una prima volta dopo l'incendio del 1836,  il teatro è vittima di un secondo incendio nel 1996.
A seguito di raccolte di fondi da parte di enti e istituzioni internazionali di tutto il mondo e dopo interminabili e controversi lavori di ricostruzione, il nuovo Teatro La Fenice viene inaugurato in diretta televisiva il 14 dicembre 2003, con l’Orchestra e il Coro del Teatro La Fenice diretta da Riccardo Muti e alla presenza, in palco reale, del Presidente della Repubblica Carlo Azeglio Ciampi.

Per festeggiare la riapertura dello storico teatro, la Fondazione Teatro La Fenice ed il Comune di Venezia, assieme alla Regione del Veneto, hanno presentato una settimana di eventi musicali nella nuova Fenice, dopo che per lungo tempo la stagione teatrale della Fenice è continuata nella tensostruttura provvisoria allestita nell’isola del Tronchetto e nel  Teatro di San Giovanni Grisostomo, attualmente denominato Malibran, e diventato la seconda sede della Fenice (la riapertura si è verificata nel maggio 2001).